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Ocurre despues de KHII, empieza con un mensaje extraño en el diario de Pepito Grillo "Debemos volver para librarles de su dolor". Pepito y Mickey deciden transformar el diario en datos, y se encuentran con que esta formando los mundos de los recuerdos del diario, pero estan corrompidos, se llenan de datos dañados, "Bugs". Crean a un Sora informatico (Data Sora) para librar a los mundos informaticos de estos bugs y encontrar el significado del mensaje.
Este Data Sora cae en su propio Descenso del corazón, donde recibe una llave espada de datos y se encuentra con un tipo con tunica de la Org. XIII. Data Sora despierta en una Islas del Destino de datos, y ahí empieza su aventura. Data Sora viaja por diferentes mundos de datos:
Islas del Destino -> Ciudad del Paso -> El País de las Maravillas -> Coliseo del Olimpo -> Agrabah -> Bastion Hueco -> Castillo del Olvido.
Data Sora va avanzando por los mundos, viendo cosas ocurridas por otros personajes durante KHI, como Riku abandonando las islas o Pluto en los corredores de la oscuridad. Su personalidad es bastante parecida a Sora, pero suele recordar que el no es mas que un ser de datos. Tiene más encontronazos con el encapuchado, y sobre el episodio de Coliseo del Olimpo descubrimos que el Rey, Donald y Goofy, que pensaban estar controlando todo lo que pasaba en el mundo virtal desde el real, tambien están dentro del mundo de datos. El encapuchado se revela como el propio diario, tomando la forma de Riku, que le ha estado guiando, pero que no sabe de donde viene el mensaje. En Agrabah se encuentra con Pete y Maléfica, que son reales y no simples copias de datos. Malefica destruye la data keyblade de Data Sora y huye. Sora, ahora indefenso, viaja a Bastion Hueco, donde se reune con Donald y Goofy. Maléfica intenta hacerse con el control del diario de pepito grillo, y vuelve a este en contra de Data Sora. Data Sora recupera la llave espada, pero esta no es de datos, si no la verdadera, ya que "Sora es Sora, no importa que no sea real", como dice Donald. Sora finalmente vence a Malefica, y se encuentra con una sombra, que en realidad es la version del propio sincorazón de Sora, y el representante de todos los bugs. Tras vencerle, empieza la restauracíón del diario, eliminando los bugs, pero aun no han resuelto el mensaje. Mickey descubre que se ha abierto otro mundo, pero tanto Data Sora como el diario de pepito han perdido sus recuerdos.
Mickey viaja a Ciudad de Paso, donde encuentra a Data Sora sin recuerdos, y le lleva a este mundo, Castillo del Olvido. Aqui Sora va recuperando los recuerdos de su viaje, pero se encuentra con un encapuchado, que no es el Diario ya que este tiene sus recuerdos borrados. Se desvela que es Roxas, contra el que lucha, y que fue el primer encapuchado que ve en el juego. Tras vencerle, aparece Namine, que le desvela la existecia de Xion, Ven, Aqua... que todos estan conectado a Sora y que le necesitan, que él debe librares de su dolor. Se sincera diciendo que ella escribio el mensaje, y que por su culpa de borrarle y restaurarle la memoria a Sora creó los bugs. Le pide a Mickey que se lo cuente a Sora, al de verdad. Data Sora le da las gracias definitivamete, en nombre del verdadero Sora. Mickey, tras retirar el diario de pepito y cerrar el mundo de datos, le escribe una carta a Sora. Esta es la carta que reciben Sora, Riku y Kairi al final de KHII, en ella pone: "Quería contártelo inmediatamente, había memorias dormidas dentro de ti, y esos fragmentos de memorias conectan hacia el futuro". "Sora, Riku, Kairi, la verdad sobre la llave espada pasa por numerosas conexiones y están dentro de vuestros corazones". "Sora, todo el mundo conectado a ti está esperandote, el unico que puede curar su tristeza eres tú". "Es posible que todos los viajes hasta ahora hayan sido fáciles en comparación con el siguiente". "Todas las cosas aunque accidentalmente fueron conectadas". "Parece que la puerta hacia un nuevo punto de partida se está abriendo".
En el final secreto de kh bbs se ve a Sora después de leer la carta, Riku le dice "¿te has decidido?", el contesta que sí, y después le dice a Kairi que tiene que partir hacia otro viaje, "pues todavía hay gente triste, y que todo lo conectado a él lo piensa arreglar", Kairi le da el amuleto de conchas de calico y le dice "ve con cuidado"
Este Data Sora cae en su propio Descenso del corazón, donde recibe una llave espada de datos y se encuentra con un tipo con tunica de la Org. XIII. Data Sora despierta en una Islas del Destino de datos, y ahí empieza su aventura. Data Sora viaja por diferentes mundos de datos:
Islas del Destino -> Ciudad del Paso -> El País de las Maravillas -> Coliseo del Olimpo -> Agrabah -> Bastion Hueco -> Castillo del Olvido.
Data Sora va avanzando por los mundos, viendo cosas ocurridas por otros personajes durante KHI, como Riku abandonando las islas o Pluto en los corredores de la oscuridad. Su personalidad es bastante parecida a Sora, pero suele recordar que el no es mas que un ser de datos. Tiene más encontronazos con el encapuchado, y sobre el episodio de Coliseo del Olimpo descubrimos que el Rey, Donald y Goofy, que pensaban estar controlando todo lo que pasaba en el mundo virtal desde el real, tambien están dentro del mundo de datos. El encapuchado se revela como el propio diario, tomando la forma de Riku, que le ha estado guiando, pero que no sabe de donde viene el mensaje. En Agrabah se encuentra con Pete y Maléfica, que son reales y no simples copias de datos. Malefica destruye la data keyblade de Data Sora y huye. Sora, ahora indefenso, viaja a Bastion Hueco, donde se reune con Donald y Goofy. Maléfica intenta hacerse con el control del diario de pepito grillo, y vuelve a este en contra de Data Sora. Data Sora recupera la llave espada, pero esta no es de datos, si no la verdadera, ya que "Sora es Sora, no importa que no sea real", como dice Donald. Sora finalmente vence a Malefica, y se encuentra con una sombra, que en realidad es la version del propio sincorazón de Sora, y el representante de todos los bugs. Tras vencerle, empieza la restauracíón del diario, eliminando los bugs, pero aun no han resuelto el mensaje. Mickey descubre que se ha abierto otro mundo, pero tanto Data Sora como el diario de pepito han perdido sus recuerdos.
Mickey viaja a Ciudad de Paso, donde encuentra a Data Sora sin recuerdos, y le lleva a este mundo, Castillo del Olvido. Aqui Sora va recuperando los recuerdos de su viaje, pero se encuentra con un encapuchado, que no es el Diario ya que este tiene sus recuerdos borrados. Se desvela que es Roxas, contra el que lucha, y que fue el primer encapuchado que ve en el juego. Tras vencerle, aparece Namine, que le desvela la existecia de Xion, Ven, Aqua... que todos estan conectado a Sora y que le necesitan, que él debe librares de su dolor. Se sincera diciendo que ella escribio el mensaje, y que por su culpa de borrarle y restaurarle la memoria a Sora creó los bugs. Le pide a Mickey que se lo cuente a Sora, al de verdad. Data Sora le da las gracias definitivamete, en nombre del verdadero Sora. Mickey, tras retirar el diario de pepito y cerrar el mundo de datos, le escribe una carta a Sora. Esta es la carta que reciben Sora, Riku y Kairi al final de KHII, en ella pone: "Quería contártelo inmediatamente, había memorias dormidas dentro de ti, y esos fragmentos de memorias conectan hacia el futuro". "Sora, Riku, Kairi, la verdad sobre la llave espada pasa por numerosas conexiones y están dentro de vuestros corazones". "Sora, todo el mundo conectado a ti está esperandote, el unico que puede curar su tristeza eres tú". "Es posible que todos los viajes hasta ahora hayan sido fáciles en comparación con el siguiente". "Todas las cosas aunque accidentalmente fueron conectadas". "Parece que la puerta hacia un nuevo punto de partida se está abriendo".
En el final secreto de kh bbs se ve a Sora después de leer la carta, Riku le dice "¿te has decidido?", el contesta que sí, y después le dice a Kairi que tiene que partir hacia otro viaje, "pues todavía hay gente triste, y que todo lo conectado a él lo piensa arreglar", Kairi le da el amuleto de conchas de calico y le dice "ve con cuidado"
Vamos que el nuevo KH3 tratara:
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De Sora en busca de todas las conexiones a su corazon, y como las hace felizes. Y supondra el fin del hilo argumental de Xehanort. Y este sera el primer gran capitulo de la saga Kingdom Hearts.